Effectif en permanents impliqués: 5 ingénieurs-chercheurs et 3 techniciens.

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Les activités propres de l’équipe soutiennent quels thèmes du GDR ? :

• Thème 1 - Approches omiques chez les espèces non modèles pour comprendre les mécanismes et effets des contaminants.

 

Axes de recherche et objectifs :

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Le laboratoire CEA-DRF « Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic » implanté sur le site du CEA Marcoule a pour mission de développer des méthodologies et technologies innovantes pour la détection d’agents pathogènes et le diagnostic, et transférer ses innovations vers le tissu industriel régional et national. Des recherches ciblées y sont conduites dans le domaine des biomarqueurs au sens large, et plus particulièrement ceux liés à l’émergence des résistances antibiotiques et des toxines, et ceux utilisables en terme de diagnostic médical et de qualité de vie des citoyens. Notamment, des approches de protéogénomique alliant génomique, transcriptomiques, et protéomiques y sont développées, permettant de définir des candidats biomarqueurs d’exposition pour toute espèce non-modèle.

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Principaux programmes de recherche en cours :

• ProteoGam, AO ANR Générique 2014 : Proteomics for novel biomarkers relevant in ecotoxicology from gammarids : challenging the biodiversity and multiplexed immunoassay as diagnostic tool (janvier 2015 – janvier 2019).

• BioSiPharm, AO ANR P2N 2013 : Sécurité biologique des nanoparticules de silice mésoporeuse selon leur recouvrement de surface et mise en place de standards d’évaluation (novembre 2013 – octobre 2017). Gammatolerans, AO ANR Blanc SVSE6 2012 : Exploration des mécanismes de radiotolérance de l’archée Thermococcus gammatolerans par des approaches génomiques et protéomiques innovantes (décembre 2012 – novembre 2016).

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Partenariats :

Partenaires ProteoGam: IRSTEA, Lyon, France (O. Geffard et A. Chaumot), Institut de Chimie de Nice UMR7272, équipe Molécules Bioactives, Valbonne, France (S. Azoulay). Partenaires BioSiPharm: Institut Charles Gerhardt (J.-M. Devoisselle). NMS NanoMedSyn (M. Garcia). Partenaires Gammatolerans: Université Paris-Sud ORSAY, Orsay, France (F. Confalonieri), CEA-Grenoble, INAC, Grenoble, France (J. Breton).

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Equipement – spécificité de l’équipe :

• Salles de biochimie & biophysique, de biologie cellulaire & moléculaire, et de microbiologie (L2 et L3).

• Plateforme de spectrométrie de masse, comportant un spectromètre de masse à trappe ionique (Esquire 3000 plus, Brucker), un spectromètre de masse à haute résolution (LTQ-Orbitrap XL), et deux spectromètres de masse nouvelle génération à très haute résolution (Q-exactive HF incorporant un analyseur orbitrap à haut champ, Thermo), ainsi que plusieurs nanoHPLC couplés aux spectromètres de masse, et serveurs informatiques pour l’interprétation de données protéomiques et protéogénomiques.

• Plateforme de production d’anticorps polyclonaux et monoclonaux, animalerie.