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IFREMER, Unité Biogéochimie et Ecotoxicologie, Nantes

Effectif en permanents impliqués: 11 CR,  5 ING,  8 TECH, 1 TA, 4 HDR, 2 thèses, 2 apprentis.

Les activités propres de l’équipe soutiennent quels thèmes du GDR ? :

  • Thème 1: Approches omiques chez les espèces non modèles pour comprendre les mécanismes et effets des contaminants

  • Thème 2: Intégration biologique, vulnérabilité des espèces pour mieux évaluer la qualité des milieux.

  • Thème 3: Les effets différés, effets multigénérations et transgénérationnels.

  • Thème 4: Mécanismes d’accumulation, devenir et transfert des contaminants le long des chaînes trophiques

 

Compétences de l’Unité :

  • Biogéochimie, chimie de l’environnement, chimie analytique (contaminants à l’état de traces), modélisation biologique, occurrence, spéciation, biodisponibilité/

   bioaccumulation, transferts trophiques des contaminants chimiques

- Écotoxicologie, toxicologie, génotoxicologie, bioessais

- Analyse du risque chimique

 

Activités de recherche :

  • -  Caractérisation de la contamination par des polluants chimiques historiques et émergents pour des espèces de différents niveaux trophiques et en tenant compte de leur cycle de vie: études des voies d’exposition et de la biodisponibilité

  • Étude de la distribution et du transfert des contaminants chimiques entre les différents compartiments de l’environnement marin (sédiment, eau, biote)

  • Étude des mécanismes de biotransformation des polluants chimiques

  • Identification de mécanismes d’action toxique à différentes échelles d’observationbiologique (de la cellule aux populations)

  • Effets génotoxiques et épigénétiques des polluants chimiques

  • Etude des effets multi- et trans-générationnels des polluants chimiques chez lesorganismes marins

  • Étude des mécanismes d’adaptation au stress chimique (modifications épigénétiques)

  • Étude de la toxicité de mélanges complexes de substances chimiques

  • Étude du transfert trophique de polluants chimiques et des effets toxiques associés

  • Proposition de marqueurs biologiques pour la surveillance du milieu marin  

  • Détermination de seuils (VGE, EAC, BAC) chimiques et écotoxicologiques et sélection des matrices appropriées à la recherche des substances

- Surveillance prospective : identification de nouveaux contaminants d’intérêt ; développement d’outils innovants (échantillonneurs passifs)

Principaux programmes de recherche en cours :

  • Projet Ifremer : COCONUT (COntamination chimique, croissance et COndition corporelle et des juvéniles de bar en NoUrriceries : étude préliminaire des liens potentiels), ExplOPE (Exploring the environmental occurrence and links between organophosphate esters additives and micro-plastics in sediments and benthic organisms from the Loire estuary), Polarpod (Contamination des mers australes),

  • TREMOLO (Distribution et devenir des éléments TRaces EMergents dans les matrices environnementales de l’estuaire de la LOire.)

  • Projets LabEx COTE : MAGMA (The West Gironde Mud Patch: an integrated model for the application of the Marine Strategy Framework Directive to marine offshore systems), CURL Contamination chimique du milieU maRin : Contribution à l'évaLuation de l'exposition aux substances chimiques pendant les activités récréatives.

  • Projets EC2CO ECODYN : TROCOCO

  • Projets/Réseaux Région Pays de la Loire: Emertroph (Transferts de contaminants émergents dans un réseau trophique estuarien)

  • Projets OFB : Veille-POP (Veille sur les nouveaux polluants organiques persistants dans les mollusques marins), VGE, Moules hybrides

  • Projet SFA : Swordfish (Contamination des prédateurs supérieurs de l'Océan Indien par les Polluants Organiques)

  • Projet CPS : Tiptop (Thons du Pacifique sud : Polluants Organiques Persisteants et microplastiques)

  • Projets ANR : PESTO (

  • Projets Internationaux : GMOS Train

Partenariats :

  • En Interne Ifremer : SG2M, PFOM, ODE/LERs, EEP, PSO.

  • Externes : UMR SEBIO, UMR LEMAR, UMR MARBEC, UMR IHPE, UMR EPOC, GRECAN Caen, UMR BOREA, LAN CEA, UMR 7621 LOMIC, TOXEM, IRD, LABERCA, Université Gustave Eiffel, IPREM-UPPA, NIVA, SFA, CPS, Université d’Oslo, CEFAS, Deltares, Université Amsterdam, Université de Copenhague, Marine Scotland Science, Thünen Institute of Fisheries-Ecology IOE.

  • -     GDR/Réseaux : GDR Écotoxicologie Animale, GDR Polymères et Océans, RTP Ecotoxicomic, LabEx COTE, AQUAREF, Norman

Equipement – spécificité de l’équipe :

  • Expertise reconnue dans la caractérisation de la contamination chimique et de ses conséquences écotoxicologiques en milieu marin. Compétences pluridisciplinaires en chimie analytique des éléments traces, chimie de l’environnement et écotoxicologie/ toxicologie

  • Élaboration et mise en œuvre du réseau d’observation ROCCH (ex-RNO) et gestion de la mytilothèque, banque d’échantillons permettant la réalisation d’analyses rétrospectives

  • Elaboration et mise en œuvre du réseau d’observation SELI (suivi des effets biologiques induits par la contamination chimique). Espèces modèles : sole, flet, moule

  • Représentation du Ministère de l’Environnement aux groupes de travail européens pour la protection du milieu marin (CIEM, OSPAR/MIME, OSPAR/HASEC, UNEP/MED POL)

  • Coordination et animation scientifique du descripteur 8 « contaminants et effets » de la DCSMM,

  • Infrastructure spécialisée pour l’analyse de traces (zone à contamination contrôlée)

  • Appareils de chimie analytique: GC-MS (EI, NCI), GC-HRMS, GC-LC/MS-MS, HPLC-UV/ED, pectrophotomètres de fluorescence atomique.

  • Appareils pour les analyses biologiques: armoires de culture thermostatées, hottes à flux laminaire, microscopes optiques et à fluorescence, cytomètre en flux BD-Accuri C6 et MACSQuant X de chez Miltenyi Biotec, Aquapen AP-C100 (PAM fluorescence), Nanodrop,Bioanalyzer, Appareils PCR quantitative, caméra CDD ultrasensible, chaîne HPLC et détecteur UV et électrochimique Coulochem III (méthylation ADN, bases oxydées ADN), lecteur de microplaques à fluorescence TECAN, spectrophotomètre Beckman, système d’analyses d’images Komet 6 (test des comètes)

  • Accès à des moyens à la mer et à des plates-formes expérimentales (écloseries expérimentales

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